1994-95赛季，曼联不仅再次遭遇加拉塔萨雷，同组的还有巴塞罗那和哥德堡。谁也没想到，笑到最后的竟然是哥德堡。这支瑞典队在小组中击败了巴塞罗那和曼联。获得第一名的资格。其中，曼联客场1-3不敌哥德堡。后来加盟曼联的布洛姆奎斯特在这场比赛中打进一球。另一场客场对阵巴塞罗那的比赛中，曼联甚至在诺坎普打入一球。 0-4失利，客场0-0战平加拉塔萨雷。曼联直到上一场主场对阵加拉塔萨雷才取得小组赛的第二场胜利，最终以2胜2平的成绩结束。 2负，排名第三，被淘汰。

曼联只能参加1995-96赛季的联盟杯。 1996-97和1997-98赛季，依靠1992一代的崛起，曼联取得了长足的进步99 00赛季欧冠曼联，进入了最终的4强和8强。1998-99赛季，曼联取得了长足的进步。就是要到达最高峰。从1999-00赛季到2002-03赛季，弗格森依靠92一代确保了欧冠成绩。这4个赛季，曼联3次打进8强，1次打入前四。

随着1992一代年老离队，曼联经历了低谷期，欧冠成绩也每况愈下。他们在2003-04和2004-05赛季都止步于前16名，并在2005-06赛季小组赛垫底。同组的还有本菲卡、里尔和比利亚雷亚尔。曼联最终取得1胜3平2负的成绩。他们客场输给里尔和本菲卡99 00赛季欧冠曼联，与比利亚雷亚尔两战平。最终他们小组垫底，连欧联杯资格都没有。踢。

随着C罗和鲁尼的崛起，曼联在欧冠赛场卷土重来，并在2006-07赛季杀入四强。 2007-08赛季，弗格森夺得第二座欧冠冠军奖杯。随后在2008-09赛季和2010-11赛季，曼联夺得了欧冠冠军。进入决赛但被巴塞罗那击败。此后，可能先繁荣，后衰落。 2011-12赛季未能从小组出线。 2012-13赛季在16强中被皇马淘汰，随后弗格森退役，由莫耶斯接替。 2013-14赛季打进8强，被拜仁淘汰。曼联上赛季无缘欧冠，本赛季重返欧冠却小组被淘汰。

附上曼联改制后的欧冠成绩单：

2015-16：小组第三，2013-14：前8，2012-13：前16，2011-12：小组第三，2010-11：亚军，2009-10：前8，2008-09 ：亚军，2007-08：冠军，2006-07：前499 00赛季欧冠曼联，2005-06：第4组，2004-05：前16，2003-04：前16，2002-03：前8，2001-02： 2000-01年：前4名，1999-00年：前8名，1998-99年：冠军，1997-98年：前8名，1996-97年：前4名，1994-95年：小组第三，1993-94年：第二轮